Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms