Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Supt6hQ62383 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Supt6hQ62383 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Supt6hQ62383 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Supt6hQ62383 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Supt6hQ62383 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Supt6hQ62383 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Supt6hQ62383 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Supt6hQ62383 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Supt6hQ62383 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Supt6hQ62383 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Supt6hQ62383 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Supt6hQ62383 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Supt6hQ62383 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Supt6hQ62383 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Supt6hQ62383 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Supt6hQ62383 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Supt6hQ62383 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Supt6hQ62383 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Supt6hQ62383 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Supt6hQ62383 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Supt6hQ62383 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Supt6hQ62383 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Supt6hQ62383 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Supt6hQ62383 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Supt6hQ62383 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Supt6hQ62383 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Supt6hQ62383 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Supt6hQ62383 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Supt6hQ62383 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Supt6hQ62383 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Supt6hQ62383 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Supt6hQ62383 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Supt6hQ62383 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Supt6hQ62383 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Supt6hQ62383 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Supt6hQ62383 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms