Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema5aQ62217 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema5aQ62217 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema5aQ62217 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema5aQ62217 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema5aQ62217 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema5aQ62217 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema5aQ62217 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema5aQ62217 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms