Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpaQ62189 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms