Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms