Protein–RNA interactions for Protein: Q62029

Pabpc2, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc2Q62029 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms