Protein–RNA interactions for Protein: Q61990

Pcbp2, Poly(rC)-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp2Q61990 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp2Q61990 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp2Q61990 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms