Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hes3Q61657 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hes3Q61657 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms