Protein–RNA interactions for Protein: Q61501

E2f1, Transcription factor E2F1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f1Q61501 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2f1Q61501 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2f1Q61501 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms