Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DbpQ60925 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DbpQ60925 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DbpQ60925 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DbpQ60925 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DbpQ60925 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DbpQ60925 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DbpQ60925 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DbpQ60925 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DbpQ60925 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DbpQ60925 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DbpQ60925 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DbpQ60925 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DbpQ60925 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DbpQ60925 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DbpQ60925 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DbpQ60925 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DbpQ60925 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DbpQ60925 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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