Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Slc6a4Q60857 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Slc6a4Q60857 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a4Q60857 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Slc6a4Q60857 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Slc6a4Q60857 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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