Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfrsf8Q60846 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf8Q60846 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf8Q60846 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf8Q60846 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf8Q60846 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf8Q60846 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf8Q60846 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf8Q60846 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf8Q60846 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf8Q60846 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf8Q60846 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf8Q60846 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf8Q60846 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf8Q60846 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms