Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

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Length 3,461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelnQ60841 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RelnQ60841 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RelnQ60841 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RelnQ60841 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RelnQ60841 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RelnQ60841 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RelnQ60841 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RelnQ60841 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RelnQ60841 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RelnQ60841 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RelnQ60841 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RelnQ60841 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RelnQ60841 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RelnQ60841 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RelnQ60841 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RelnQ60841 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RelnQ60841 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RelnQ60841 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RelnQ60841 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RelnQ60841 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RelnQ60841 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RelnQ60841 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RelnQ60841 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RelnQ60841 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RelnQ60841 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RelnQ60841 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RelnQ60841 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RelnQ60841 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RelnQ60841 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RelnQ60841 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RelnQ60841 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RelnQ60841 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RelnQ60841 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RelnQ60841 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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RelnQ60841 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RelnQ60841 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RelnQ60841 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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RelnQ60841 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RelnQ60841 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RelnQ60841 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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RelnQ60841 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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RelnQ60841 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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RelnQ60841 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RelnQ60841 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RelnQ60841 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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RelnQ60841 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RelnQ60841 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RelnQ60841 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RelnQ60841 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RelnQ60841 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RelnQ60841 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RelnQ60841 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RelnQ60841 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RelnQ60841 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RelnQ60841 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RelnQ60841 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RelnQ60841 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RelnQ60841 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RelnQ60841 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RelnQ60841 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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