Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdkn2cQ60772 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms