Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stxbp3Q60770 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms