Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CttnQ60598 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CttnQ60598 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CttnQ60598 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CttnQ60598 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CttnQ60598 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CttnQ60598 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CttnQ60598 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CttnQ60598 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CttnQ60598 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CttnQ60598 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CttnQ60598 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms