Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sin3aQ60520 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms