Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJY5

Arcn1, Coatomer subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Arcn1Q5XJY5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Arcn1Q5XJY5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Arcn1Q5XJY5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Arcn1Q5XJY5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Arcn1Q5XJY5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Arcn1Q5XJY5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Arcn1Q5XJY5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arcn1Q5XJY5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arcn1Q5XJY5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arcn1Q5XJY5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arcn1Q5XJY5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arcn1Q5XJY5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Arcn1Q5XJY5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arcn1Q5XJY5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arcn1Q5XJY5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arcn1Q5XJY5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Arcn1Q5XJY5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arcn1Q5XJY5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arcn1Q5XJY5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Arcn1Q5XJY5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Arcn1Q5XJY5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Arcn1Q5XJY5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Arcn1Q5XJY5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arcn1Q5XJY5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Arcn1Q5XJY5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arcn1Q5XJY5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arcn1Q5XJY5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arcn1Q5XJY5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arcn1Q5XJY5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arcn1Q5XJY5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arcn1Q5XJY5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arcn1Q5XJY5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arcn1Q5XJY5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arcn1Q5XJY5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arcn1Q5XJY5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arcn1Q5XJY5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arcn1Q5XJY5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arcn1Q5XJY5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arcn1Q5XJY5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms