Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp13a3Q5XF89 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp13a3Q5XF89 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms