Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tnfsf15Q5UBV8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf15Q5UBV8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms