Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scaf1Q5U4C3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scaf1Q5U4C3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scaf1Q5U4C3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scaf1Q5U4C3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Scaf1Q5U4C3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf1Q5U4C3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf1Q5U4C3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf1Q5U4C3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf1Q5U4C3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf1Q5U4C3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf1Q5U4C3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf1Q5U4C3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf1Q5U4C3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf1Q5U4C3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf1Q5U4C3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf1Q5U4C3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf1Q5U4C3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf1Q5U4C3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf1Q5U4C3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf1Q5U4C3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf1Q5U4C3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf1Q5U4C3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf1Q5U4C3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf1Q5U4C3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf1Q5U4C3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf1Q5U4C3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf1Q5U4C3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf1Q5U4C3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf1Q5U4C3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scaf1Q5U4C3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms