Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r195Q5SVD6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r195Q5SVD6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms