Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Bbs12Q5SUD9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Bbs12Q5SUD9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Bbs12Q5SUD9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Bbs12Q5SUD9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Bbs12Q5SUD9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Bbs12Q5SUD9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Bbs12Q5SUD9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Bbs12Q5SUD9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Bbs12Q5SUD9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Bbs12Q5SUD9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Bbs12Q5SUD9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Bbs12Q5SUD9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Bbs12Q5SUD9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Bbs12Q5SUD9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Bbs12Q5SUD9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Bbs12Q5SUD9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Bbs12Q5SUD9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Bbs12Q5SUD9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Bbs12Q5SUD9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Bbs12Q5SUD9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms