Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms