Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim41Q5NCC3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Trim41Q5NCC3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim41Q5NCC3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim41Q5NCC3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim41Q5NCC3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim41Q5NCC3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim41Q5NCC3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim41Q5NCC3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim41Q5NCC3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim41Q5NCC3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim41Q5NCC3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim41Q5NCC3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim41Q5NCC3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim41Q5NCC3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim41Q5NCC3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim41Q5NCC3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim41Q5NCC3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim41Q5NCC3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms