Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBU8

Xaf1, XIAP-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xaf1Q5NBU8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xaf1Q5NBU8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms