Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc8bQ5DU41 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms