Protein–RNA interactions for Protein: Q497L3

Gm5800, Predicted gene 5800, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5800Q497L3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5800Q497L3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5800Q497L3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5800Q497L3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5800Q497L3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5800Q497L3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5800Q497L3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5800Q497L3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5800Q497L3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5800Q497L3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5800Q497L3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5800Q497L3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5800Q497L3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5800Q497L3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5800Q497L3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5800Q497L3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5800Q497L3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5800Q497L3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5800Q497L3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5800Q497L3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5800Q497L3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5800Q497L3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5800Q497L3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5800Q497L3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5800Q497L3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5800Q497L3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5800Q497L3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms