Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms