Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Cldn34b4Q3V0X2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Cldn34b4Q3V0X2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Cldn34b4Q3V0X2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Cldn34b4Q3V0X2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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