Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0B4

Cfap65, Cilia- and flagella-associated protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 1,847 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap65Q3V0B4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cfap65Q3V0B4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap65Q3V0B4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap65Q3V0B4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap65Q3V0B4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap65Q3V0B4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap65Q3V0B4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap65Q3V0B4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap65Q3V0B4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap65Q3V0B4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap65Q3V0B4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap65Q3V0B4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap65Q3V0B4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap65Q3V0B4 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap65Q3V0B4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms