Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm44Q3V089 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rbm44Q3V089 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm44Q3V089 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms