Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slfn4Q3UV66 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms