Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms