Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap2Q3UND0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms