Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms