Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc34Q3UI66 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms