Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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