Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rufy4Q3TYX8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy4Q3TYX8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy4Q3TYX8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy4Q3TYX8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy4Q3TYX8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy4Q3TYX8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy4Q3TYX8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy4Q3TYX8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy4Q3TYX8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy4Q3TYX8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy4Q3TYX8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy4Q3TYX8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy4Q3TYX8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy4Q3TYX8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy4Q3TYX8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy4Q3TYX8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy4Q3TYX8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy4Q3TYX8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy4Q3TYX8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy4Q3TYX8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy4Q3TYX8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rufy4Q3TYX8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy4Q3TYX8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy4Q3TYX8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy4Q3TYX8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy4Q3TYX8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy4Q3TYX8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy4Q3TYX8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy4Q3TYX8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy4Q3TYX8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy4Q3TYX8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy4Q3TYX8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy4Q3TYX8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy4Q3TYX8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy4Q3TYX8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy4Q3TYX8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy4Q3TYX8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy4Q3TYX8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy4Q3TYX8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rufy4Q3TYX8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms