Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43aQ3TL54 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43aQ3TL54 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43aQ3TL54 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43aQ3TL54 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43aQ3TL54 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43aQ3TL54 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43aQ3TL54 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43aQ3TL54 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43aQ3TL54 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43aQ3TL54 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43aQ3TL54 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43aQ3TL54 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43aQ3TL54 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43aQ3TL54 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43aQ3TL54 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43aQ3TL54 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43aQ3TL54 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43aQ3TL54 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43aQ3TL54 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43aQ3TL54 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43aQ3TL54 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43aQ3TL54 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43aQ3TL54 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43aQ3TL54 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43aQ3TL54 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43aQ3TL54 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim43aQ3TL54 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim43aQ3TL54 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim43aQ3TL54 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim43aQ3TL54 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim43aQ3TL54 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim43aQ3TL54 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim43aQ3TL54 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim43aQ3TL54 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim43aQ3TL54 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim43aQ3TL54 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim43aQ3TL54 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim43aQ3TL54 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms