Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Smarca4Q3TKT4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarca4Q3TKT4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms