Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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