Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms