Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms