Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim71Q1PSW8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms