Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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Fam171bQ14CH0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Fam171bQ14CH0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Fam171bQ14CH0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Fam171bQ14CH0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Fam171bQ14CH0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Fam171bQ14CH0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Fam171bQ14CH0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam171bQ14CH0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms