Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ptcd3Q14C51 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Ptcd3Q14C51 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Ptcd3Q14C51 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Ptcd3Q14C51 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
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