Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ptchd1Q14B62 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms