Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Ttc39dQ0VF76 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Ttc39dQ0VF76 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Ttc39dQ0VF76 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Ttc39dQ0VF76 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Ttc39dQ0VF76 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Ttc39dQ0VF76 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Ttc39dQ0VF76 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Ttc39dQ0VF76 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Ttc39dQ0VF76 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Ttc39dQ0VF76 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
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Ttc39dQ0VF76 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Ttc39dQ0VF76 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Ttc39dQ0VF76 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms