Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrioQ0KL02 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms